Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms