Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Colca2F8VPY8 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms