Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Usp9yF8VPU6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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