Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms