Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo5cE9Q1F5 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms