Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms