Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms