Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm3543D3Z235 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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