Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd1D3YXK1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms