Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.6 ms