Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NhsB1AV60 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms