Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms