Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pramel3A2AHA7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pramel3A2AHA7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramel3A2AHA7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms