Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PtprfA2A8L5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PtprfA2A8L5 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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