Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb4A2A863 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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