Protein–RNA interactions for Protein: A2A7W1

Cd300ld4, CD300 molecule-like family member D4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld4A2A7W1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd300ld4A2A7W1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms