Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17190V9GX38 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms