Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms