Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mbd3Q9Z2D8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Mbd3Q9Z2D8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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