Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms