Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms