Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mid2Q9QUS6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms