Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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