Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms