Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms