Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hmgn5Q9JL35 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hmgn5Q9JL35 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hmgn5Q9JL35 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hmgn5Q9JL35 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hmgn5Q9JL35 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hmgn5Q9JL35 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hmgn5Q9JL35 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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