Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms