Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClpxQ9JHS4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClpxQ9JHS4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ClpxQ9JHS4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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