Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Scn4aQ9ER60 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn4aQ9ER60 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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