Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ap1s2Q9DB50 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ap1s2Q9DB50 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms