Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf138rt1Q9D9M9 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf138rt1Q9D9M9 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf138rt1Q9D9M9 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf138rt1Q9D9M9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms