Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gtf3c6Q9D8P7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gtf3c6Q9D8P7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gtf3c6Q9D8P7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gtf3c6Q9D8P7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gtf3c6Q9D8P7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gtf3c6Q9D8P7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gtf3c6Q9D8P7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gtf3c6Q9D8P7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gtf3c6Q9D8P7 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gtf3c6Q9D8P7 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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