Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q9D7E4 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms