Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Snapc3Q9D2C9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms