Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NkapQ9D0F4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NkapQ9D0F4 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms