Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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