Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shmt2Q9CZN7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shmt2Q9CZN7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms