Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Pfdn1Q9CWM4 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn1Q9CWM4 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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