Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms