Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Fcf1Q9CTH6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Fcf1Q9CTH6 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Fcf1Q9CTH6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Fcf1Q9CTH6 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Fcf1Q9CTH6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Fcf1Q9CTH6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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