Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PompQ9CQT5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PompQ9CQT5 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PompQ9CQT5 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PompQ9CQT5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PompQ9CQT5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PompQ9CQT5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PompQ9CQT5 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PompQ9CQT5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PompQ9CQT5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PompQ9CQT5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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