Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms