Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NsmfQ99NF2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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