Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1b4Q99ME6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms