Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ciao1Q99KN2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms