Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms