Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ddb2Q99J79 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ddb2Q99J79 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ddb2Q99J79 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ddb2Q99J79 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ddb2Q99J79 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ddb2Q99J79 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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