Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
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Cldn16Q925N4 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn16Q925N4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms