Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 828 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nrif1Q923B3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Nrif1Q923B3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms