Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Slc6a20aQ8VDB9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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